Balai Penelitian Sungei Putih (BPSP) adalah unit kerja penelitian dan pengembangan yang berada di bawah Pusat Penelitian Karet (PPK), Lembaga Riset Perkebunan Indonesia (LRPI). Lembaga penelitian karet ini memiliki sejarah yang panjang. Bermula pada tahun 1916 didirikan Algemeen Proeffstation de AVROS merupakan lembaga penelitian milik perkebunan karet Belanda bernama AVROS (Algemeen Vereniging Van Rubber Planters Ost Kust Van Sumatra.) Pada tahun 1952 AVROS disatukan dengan Deli Planters Veregining, pada tahun 1957 dirubah menjadi RISPA (Research Institute of The Sumatera Planters Association) selanjutnya pada tahun 1968 dirubah menjadi Balai Penelitian Perkebunan (BPP) Medan dengan mandat penelitian komoditas Karet, Kelapa Sawit, dan Coklat.

Pembentukan BPSP yang dimulai sejak tahun 1981 sudah beberapa kali berganti nama dikarenakan adanya reorganisasi lembaga penelitian. Diawali dari SK Menteri Pertanian RI No. 790/Kpts/Org/1981 tentang berdirinya Balai Penelitian Perkebunan Sungei Putih (1981-1989), yang kemudian berubah menjadi Pusat Penelitian Perkebunan (Puslitbun) Sungei Putih (1989-1992) berdasarkan SK Menteri Pertanian RI No.823/Kpts/KB.110/89 dan SK AP3I No. 222/APP/89. Selanjutnya, berdasarkan segi mandat komoditas Puslitbun Sungei Putih, bersama Puslitbun Sembawa, Puslitbun Getas, dan bagian Pasca Panen Karet pada Puslitbun Bogor dikelompokkan menjadi Pusat Penelitian Karet (1992-2003) berdasarkan SK DPH-AP3I No. 084/Kpts/DPH/XII/92 yang berkedudukan di Sungei Putih. Dengan penggabungan tersebut, kelima Puslitbun berfungsi sebagai unit kegiatan penelitian Pusat Penelitian Karet (PPK) dan melalui keputusan DPH-AP3I No. 059/93 nama Puslitbun Sembawa diubah menjadi Balai Penelitian Sembawa, Puslitbun Getas diubah menjadi Balai Penelitian Getas, dan Bagian Pasca Panen Karet Puslitbun Bogor dirubah menjadi Balai Penelitian Teknologi Karet Bogor.

Pada tahun 2003 terjadi reorganisasi pada lembaga Pusat Penelitian Karet yang semula berkedudukan di Sungei Putih berpindah tempat di Tanjung Morawa, sedangkan Sungei Putih berubah naman menjadi Balai Penelitian Sungei Putih berdasarkan SK Direktur Eksekutif LRPI No06/Kpts/LRPI/2003, tanggal 26 Maret 2003.